又称pcr技术是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。 它具有特异、敏感、产率高、 快速、 简便、重复性好、易自动化等突出优点。1985年美国pe-cetus公司人类遗传研究室的mullis 等发明了具有划时代意义的聚合酶链反应。
【原理和方法】dna是由四种碱基按互补配对原则(即腺嘌呤a对胸腺嘧啶t,鸟嘌呤g对胞嘧啶c)组成的螺旋双链。在细胞内,dna复制时,解螺旋酶首先解开双链让它变成单链做为模板,然后,另一种酶--rna聚合酶合成一小段引物(primer)结合到dna模板上,最后,dna合成酶以这段引物为起点,合成与dna模板配对的新链。pcr即是在体外模拟dna复制的过程,它用加热的办法让所研究的dna片段变性变成两条单链,人工合成两个引物让它们结合到dna模板的两端,dna聚合酶即可以大量复制该模板。
假定我们要研究的dna双链两端的序列是:
tattcgggctttccaagcaactag...........gatctatccaacggctaggcatttataagcccgaaaggttcgttgatc...........ctagataggttgccgatccgtaaa在pcr之前,我们首先人工合成两段有20-30碱基的引物,能够分别与上下两条链的一端配对,比如一条是(为与模板能够区别,以小写表示):ataagcccgaaaggttcgtt,另一条就是tttacggatcggcaacctat。把这两段引物和dna模板、dna聚合酶、底物(四种脱氧核苷)混合在一起,我们就可以开始做pcr了。
第一步叫“变性”,把样品加热到94-96摄氏度一到数分钟,让dna模板变性变成单链。
第二步叫“退火”,让样品的温度下降到50-65摄氏度一到数分钟,引物就可以结合到模板上去。
tattcgggctttccaagcaactag...........gatctatccaacggctaggcatttataagcccgaaaggttcgtttatccaacggctaggcatttataagcccgaaaggttcgttgatc...........ctagataggttgccgatccgtaaa第三步叫“延伸”,让样品的温度上升到72摄氏度一到数分钟,dna聚合酶就可以从引物开始用底物复制出新链。
tattcgggctttccaagcaactag...........gatctatccaacggctaggcatttataagcccgaaaggttcgttgatc...........ctagataggttgccgatccgtaaatattcgggctttccaagcaactag...........gatctatccaacggctaggcatttataagcccgaaaggttcgttgatc...........ctagataggttgccgatccgtaaa这样经过三步一个循环,一条双链就变成了两条,再来一个循环,就变成了四条……在一个由计算机控制的循环加热器上经过三十个循环,就可以把原来的样品精确地扩增了2的30次方倍,而这只需要两三个小时。pcr要成功,必须要有能够忍耐高温、在高温下仍然能有活性的dna聚合酶。这种酶可从生活在温泉中的细菌中提取,其中最常用的一种叫taq聚合酶。野生型的taq聚合酶保真度较差,在复制比较长的模板时容易发生点突变。通过遗传工程,我们已获得了高保真度的taq聚合酶,大大提高了pcr复制的精确程度。
【应用】在分子生物学基础研究上,pcr被广泛地用于基因克隆和制造突变。在临床医学上,pcr被用于鉴别遗传疾病和快速检测病毒、病菌感染。用传统的方法,要检测病毒、病菌的感染需要把病原体培养数周才能鉴定,而现在用pcr,即可以迅速判断人体细胞(比如血液细胞)中是否存在病毒、病菌的dna(比如hiv的dna)而确诊。
在法医上,pcr目前已成为发现罪证的重要方法。比如,0•1微升的唾液痕迹所含的dna就可以通过pcr扩增而获得足够量的dna进行测序鉴定罪犯。毛发、血迹、唾沫、精液因此都可以成为重要的罪证。利用pcr技术,科学家们已从林肯的头发和血液、埃及的木乃伊、琥珀中八千万年前的昆虫、恐龙的骨头等不寻常的样品中提取了足够的dna进行研究。博物馆中的化石标本都有可能成为遗传学的研究对象,一门分子古生物学因此诞生。